دانشگاه علوم پزشکی ایران در بازه جهانی 901 تا 1000 رتبه‌بندی شده و در زیرمجموعه‌های وزارت بهداشت به‌عنوان سومین و در زیرمجموعه‌های وزارت علوم و بهداشت به‌عنوان ششمین دانشگاه برتر کشور شناخته می‌شود.این رتبه‌بندی از شش شاخص اصلی برای ارزیابی دانشگاه‌های جهان استفاده می‌کند: تعداد دانش‌آموختگان برنده جوایز نوبل و مدال‌های فیلدز تعداد اعضای هیئت‌علمی برنده جوایز نوبل و مدال‌های فیلدز، مقالات منتشرشده در مجلات Nature و Science، پژوهشگران پر استناد طبق مؤسسه کلاریویت، مقالات نمایه‌شده در پایگاه‌ Web of Science در نمایه‌های نمایه استنادی علوم و علوم اجتماعی و سرانه عملکرد دانشگاهی.منابع داده این رتبه‌بندی شامل وب‌سایت‌های جوایز نوبل و مدال فیلدز، پایگاه‌های اطلاعاتی و آمارهای دولتی است.